1903 yılında yaptığı çalışma ile atomun yapısını üzümlü keke benzetmiştir. Kekin kendisi pozitif yüklere, üzümleri ise negatif yüklere benzetmiştir.
Thomson’a göre ;
# Atomda negatif yük sayısı kadar pozitif yük vardır. Bu nedenle atom yüksüzdür.
# Bu yükler atomda homojen dağılmışlardır.
# Atom yarıçapı yaklaşık 10-8cm’dir.
# Elektronların kütlesi çok küçük olduğundan atomun kütlesini pozitif yüklü tanecikler oluşturur.
Thomson Atom Modelinin Eksikleri İse
# Yüklü tanecikler atoma homojen dağılmamışlardır.
# Ayrıca nötronlardan bahsedilmemiş.