Sınıflandırma bilimi taksonomidir.

İlk sınıflandırma Aristo tarafından yapılan basit (ampirik) sınıflandırmadır.

Basit sınıflandırmada; Canlının yaşadığı ortam ve dış görünüşü dikkate alınmıştır.
Örnek: Karada, havada ve suda yaşayanlar. Otlar, çalılar ve ağaçlar

Bilimsel (Doğal=Filogenetik) Sınıflandırma:
Canlıların evrimsel gelişmişlikleri akrabalık dereceleri ve köken (orjin) birliği dikkate alınarak yapılan sınıflandırmadır.
Bilimsel Sınıflandırmada:

• Protein benzerliği
• Fizyolojik benzerlik
• Embriyolojik benzerlik
• Homolog organlar dikkate alınır.

Homolog organ: Görev ve şekilleri farklı, yapıları aynı olan organlara denir.
Örnek: Atın ayağı – insanın kolu
Örnek: Yarasanın kanadı – balinanın yüzgeci

Bilimsel sınıflandırmanın dikkate almadıkları:

• Kromozom sayısı
• Canlının dış görünüşü
• Canlının yaşadığı ortam
• Analog organ

Anolog Organ: Görev ve şekilleri aynı yapıları farklı olan organlara denir.
Örnek: Kuşun kanadı – Kelebeğin kanadı.

• Evrimsel akrabalık arttıkça tepki olarak üretilen antikor azalır.