- Ülke topraklarının çok geniş olması ve birden fazla ulusu barındıran bir imparatorluk olunması
- Geleneksel veraset sisteminden dolayı çıkan taht kavgaları
- Ülkenin hanedan üyelerinin ortak malı sayılmasından dolayı hanedan üyelerine çok geniş yetkiler verilmesi, bu durumdan yararlanan hanedan üyelerinin bağımsız devletler kurması (Anadolu, Suriye, Irak, Horasan, Kirman Selçuklu devletleri)
- Şehzadeleri eğiten Atabeylerin, merkezi otoritenin zayıflamasıyla kendi devletlerini kurmaları (Zengiler (Musul), Börililer (Şam), İldenizoğulları (Azerbaycan), Salgurlular (İran) Beg Teginoğulları (Erbil)
- Haçlı Savaşlarının vermiş olduğu sarsıntı
- Batınilerin zararlı faaliyetleri
- Türkmenlerin küstürülmesi
- Eski güçlerine ulaşmak isteyen Abbasilerin zararlı faaliyetleri
- 1153 yılında çıkan Oğuz İsyanı’ndan sonra devlet yıkılma sürecine girmiştir.
- 1153 yılında Oğuzlar’ın eline tutsak düşen Sultan Sencer 2 yıl sonra ellerinden kurtulmayı başarsa da ülkesinde iktidarı sağlayamadan 1157 yılında ölmüştür. Sultan Sencer’in ölümüyle de Büyük Selçuklu Devleti 1157 yılında resmen yıkılmıştır.